化学药和生物、生化药
2008年化学药品原药制造、化学药品制剂制造、生物制品业依然是我国医药制造工业的主要构成，三个子领域合计完成工业总产值的57%以上，完成新产品产值的65%。
存在问题：
销售和利润增速放缓，但仍高于其它行业增幅。2009年1～5月医药工业实现生产产值3568.32亿元，同比增长17.10%，低于上年同期8.25个百分点。其中，化学原料药和化学药品制剂分别完成714.47亿元和1090.49亿元；化学原料药比去年同期662.52亿元同比增长了7.87%，化学药品制剂同比增长18.73%，比上年同期下降了9.76个百分点。生物制药工业完成工业总产值308.74亿元，同比增长21.38%，增幅较去年同期上升了4.8个百分点。
利润增幅降低。2009年医药工业1～5月实现利润总额332.68亿元，同比增长17.90%，增幅呈现回落的态势。其中，化学原料药、化学药品制剂分行业利润同比各增长-4.13%和16.83%；生物生化制品利润增速同比增长20.69%,比去年的增幅下降了27.44个百分点。
医疗器械
2008年医疗器械行业产销率为96.35%，高于整个医药工业平均水平，2008年医疗器械行业资本负债率下降。从其它经济指标看，2008年主要指标多数表现为提高，反映出行业整体运营管理绩效明显提高。2008年成本费用上升，利润率有所下降，反映出行业整体经济效益提升难度有所加大。
存在问题：
中国医疗器械行业的产业集中度偏低。中国有12530家医疗器械企业，其中销售额1亿元以上的生产企业约为120家，销售额在10亿元以上的企业仅为13家，他们的国内市场份额不到10%，大部分为中小规模的企业。
中国医疗器械行业的研发创新能力与先进国家相差较远。中国医疗器械行业政策监管体系不够完善。
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